Cơ sở Khoa học Xã hội và Nhân văn ở Seoul được xây dựng gần học phủ Thành Quân quán cũ. Ở gần đó là Xương Đức Cung (Changdeokgung) và Xương Khánh cung, hai trong số các cung điện hoàng gia của Seoul, và Tông Miếu (Jongmyo). Tọa độ:37°35′13,5″B 126°59′38,5″Đ / 37,58333°B 126,98333°Đ / 37.58333; 126.98333.

Cơ sở Khoa học Tự nhiên được đặt ở Suwon, gần với Nhà ga Sungkyunkwan, phía tây-bắc thành phố. Tọa độ: 37°17′36″B 126°58′28,5″Đ / 37,29333°B 126,96667°Đ / 37.29333; 126.96667. Khoa Nông Lâm của trường sở hữu những cánh đồng thử nghiệm, đặt tại 37°17′21,5″B 126°58′5″Đ / 37,28333°B 126,96806°Đ / 37.28333; 126.96806.